Buenas Tardes, yo había entendido que era el wave el que se estropeaba al pasar a ac3, ahora está más que claro, si trabajas el audio formato AAC, no vas a poder realizar tu trabajo jamás.
Un ejemplo de lo que digo para quienes tienen tiempo y ganas, simplemente cargan el audio en formato ACC en el vegas pro, y al maximizar las pistas de audio jamás podrán sincronizar se mueve todo y no te permite sincronizar, es por ello que jamás las trabajo en esos formatos, siempre trabajo todo en formato wave.
Saludos!